A PhD position is available for a project on deep learning for protein design, jointly offered by Sorbonne University and Grenoble Alpes University. The project aims to identify sequence variations induced by alternative splicing that are relevant to protein function, and use this information to train a probabilistic model for protein design. The project will involve experiments with encoder-decoder, attention mechanism, and active learning.
Сериал Атом от BBC рассказывает о научном поиске за последние 100 лет, борьбе идей и личностей, о современных проблемах в физике. Ведущий - профессор физики Джим Аль-Халили. Серии: Битва титанов, Ключ от космоса, Иллюзия действительности.
Университет Мадрида ищет молодых и талантливых людей для работы в области квантовой химии. На позицию требуется разработка численных инструментов для моделирования экспериментов ультрабыстрой спектроскопии. Контракт на 2 года, начало работы - апрель 2021 года. Зарплата - 16 764 евро в год. Проекты включают исследования химических связей в режиме реального времени в лазерных центрах XFELs и изучение оптических свойств двумерных материалов.
Статья о поиске химических соединений с помощью Генеративно-Топографического Маппирования (GTM) в базах данных ChEMBL и ZINC. Показаны результаты поиска соединений, которые были протестированы в базе данных ChEMBL и показали высокую активность, но отсутствуют в базе данных ZINC, а также соединений, которые есть в базе ZINC, они предсказаны как активные, но их нет в базе ChEMBL. Найденные соединения были добавлены в базу данных PubChem спустя 6 месяцев после скачивания базы ChEMBL.
Статья рассказывает о преимуществах цифрового хранения химических данных, таких как облегченный поиск, возможность легко делиться данными, следить за работой и качеством оформления журналов подчиненных, реализации инструментов моделирования и рекомендательных систем, сочленение со складом реактивов. Однако, многие исследователи не доверяют интернету и боятся слежки или утечки вследствие ошибки. Статья также упоминает статью в Nature о том, как цифровизация может дать синтетической химии новые возможности.
В статье рассказывается о конференции 'AI for Reaction Outcome and Synthetic Route Prediction', на которой были представлены интересные доклады по теме хемоинформатики. Особенностью конференции был полноценный отчет о ней, который включал краткое изложение всех устных докладов. Рекомендуется для тех, кто интересуется информатикой химических реакций.
Компания Roche и Минпромторг России проводят конкурс инновационных фармацевтических и медицинских проектов «Стартап-ралли», цель которого - выявить перспективные научные разработки в области фармацевтики и медицины. Принимаются проекты по 6 направлениям, победители получат экспертную и консалтинговую поддержку, программы продвижения и участие в работе корпоративных акселераторов. Финал конкурса состоится в сентябре 2020 года, заявки на участие принимаются до 30 июня 2020 года на сайте http://startuprally.ru.
Магистратура по Хемоинформатике и молекулярному моделированию в Казанском университете - это мультидисциплинарное направление на стыке химии, информатики, биологии, математики и статистики, которая, в основном, применяется для компьютерного поиска целевого соединения (в том числе лекарства), материала или реакции, оперирования большими данными в химии. После завершения магистратуры вы получаете редкую и востребованную мультидисциплинарную специализацию (машинное обучение, программирование, химия) с высоким уровнем зарплат. Мы сотрудничаем с крупными российскими (BIOCAD, InSilico, Сибур) и зарубежными компаниями (Janssen, Elsevier).
В статье описываются хорошие новости от выпускников и студентов, связанные с получением стипендий и выполнением исследований в Университете Страсбурга. Также упоминается стипендия Потанина для студента магистратуры.